La Fraternité est organisée en trois branches :
Les Clercs et les Frères
Ils sont la branche masculine historique de la Fraternité. Ils vivent en commun ou dans la société, où ils travaillent aux oeuvres apostoliques, dans l'esprit missionnaire.
Les Soeurs
Elles vivent en communauté ou dans le monde au sein de la société, où elles peuvent travailler à l'apostolat. Leur mission sera davantage tournée vers les familles et les femmes.
Le Tiers Ordre
Il regroupe aussi bien des personnes célibataires que mariées, les Associés, qui souhaitent s'associer à la spiritualité et aux activités de la Fraternité.